Zavedenie inovatívneho testu pre screening a monitoring onkologických pacientov - GenoScan LBquant

Predkladaný projekt je zameraný na inovatívnu transformáciu aktuálne dostupného a používaného testu spoločnosti Geneton (GenoScan), ktorý je založený na analýze celého genómu a je zameraný na identifikáciu chromozómových a veľkých subchromozómových porúch za účelom prenatálnej diagnostiky.

Zo základných princípov testu GenoScan, ako aj z určitých biologických zákonitostí, však predpokladáme, že by malo byť možné využiť princípy a technológie uvedeného testu nielen v doméne prenatálnej diagnostiky, ale aj v doméne onkologického skríningu a včasnej diagnostiky onkologických ochorení.

Opodstatnenia tohto predpokladu pramení zo skutočnosti, že nádor podobne ako plod u tehotnej ženy, uvoľňuje svoju DNA do krvi jeho "hostiteľa", čiže do cirkulácie pacienta postihnutého daným nádorom, konkrétne do plazmatickej frakcie.

preto využitie doterajších skúseností odborných tímov Geneton s.r.o. a Vedeckého parku Univerzity Komenského s vyššie spomínanými celogenómovými analýzami v oblasti prenatálnej diagnostiky z tekutých biopsíí (zo vzoriek periférnej krvi získanej klasickým odberom krvi) na založeného na analogických princípoch (s určitými zdokonaleniami najmä v laboratórnej metodike a bioinformatickej analýzy), avšak na diametrálne iné účely, tj.

Projekt bude prebiehať prostredníctvom dvoch aktivít:

• ,  ktorý pozostáva z nasledovných etáp:  
  • Zber vzoriek, vedenie elektronickej dokumentácie ku vzorkám
  • Histopatologická charakterizácia nádorového tkaniva
  • Izolácie nukelových kyselín
  • Laboratórne spracovanie na dvojitú analýzu frakcie krvnej plazmy a buffy coat
  • Identifikovať bežnú a častú štruktúrnu variabilitu v zdravej populácií a u pacientov (odstránenie artefaktov pri analýze)
  • Vyvinúť algoritmus pre porovnanie profilov plazmy, tumoru a buffy coatu a implementácie sledovania časového radu
  • Testovať metódu a algoritmus na vzorkách od pacientov s potvrdeným nádorom prostaty (štúdia na skupine 100 vzorkách krvi pacientov) 
  • Porovnanie a hodnotenie pozorovaných CNV variantov 
  • Pilotná promoakcia

• , v rámci ktorej dôjde k optimalizácii výrobných procesov pre zabezpečenie ponuky nových testov v požadovanej kvalite a početnosti. Uvedená aktivita bude realizovaná bez potreby dodatočných investičných výdavkov.

je viazaná na existujúce priestory žiadateľa, konkrétne laboratóriá lokalizované na Novozámockej ulici č. 67 v Nitre.

Realizáciou projektu prispejeme  k plneniu merateľných ukazovateľov s nenulovými hodnotami na projektovej úrovni pre OP VaI, prioritná os 1, špecifický cieľ 1.2.2:

• Počet podnikov, ktoré dostávajú granty.
• Počet produktov, ktoré sú pre firmu nové.
• Počet podnikov, ktoré dostávajú podporu s cieľom predstaviť výrobky, ktoré sú pre firmu nové.
• Počet produktov, ktoré sú pre trh nové.
• Počet podnikov, ktoré dostávajú podporu s cieľom predstaviť výrobky, ktoré sú pre trh nové.
• Počet podnikov spolupracujúcich s výskumnými inštitúciami.
• Počet prihlášok registrácie práv duševného vlastníctva.
• Počet podaných patentových prihlášok.
• Počet podporených výskumných inštitúcií.
• Počet podporených výskumných inštitúcií spolupracujúcich s podnikmi.
• Nárast zamestnanosti v podporovaných podnikoch.
• Počet nových výskumných pracovníkov v podporovaných subjektoch/podnikoch.